Unity付属のMonodevelopでブレークポイントを使う方法について。
ブレークポイントを使いこなせると、かなりデバッグが楽になるので、ぜひとも使いこなしたい所。

Unity&monodevelopでブレークポイント from Ryohei Tokimura

デバッガ / Debugger(公式リファレンス)
http://docs-jp.unity3d.com/Documentation/Manual/Debugger.html
MonoDevelop デバッグ方法(M3 creator)
http://unity.creator.ms/unity-002.html
UnityをMonoDevelopでデバッグする(tkd55 blog)
http://www.tkd55.net/blog/?p=497
tsubakit1.hateblo.jp